Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms