Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms