Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms