Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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PtprbB2RU80 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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PtprbB2RU80 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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