Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Prrt4B2RU40 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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