Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rrn3B2RS91 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rrn3B2RS91 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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