Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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