Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms