Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms