Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc163A2AGD7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc163A2AGD7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.1 ms