Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cyb561d1A2AE42 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms