Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Crlf3Q9Z2L7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Crlf3Q9Z2L7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Crlf3Q9Z2L7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Crlf3Q9Z2L7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Crlf3Q9Z2L7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Crlf3Q9Z2L7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Crlf3Q9Z2L7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Crlf3Q9Z2L7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Crlf3Q9Z2L7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Crlf3Q9Z2L7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Crlf3Q9Z2L7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms