Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme4Q9WV84 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme4Q9WV84 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nme4Q9WV84 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nme4Q9WV84 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nme4Q9WV84 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nme4Q9WV84 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms