Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr54Q9R0D8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr54Q9R0D8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Wdr54Q9R0D8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Wdr54Q9R0D8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms