Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tnnt3Q9QZ47 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnnt3Q9QZ47 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms