Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rai2Q9QVY8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rai2Q9QVY8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rai2Q9QVY8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms