Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Csnk1eQ9JMK2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms