Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D6

XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 950 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRN2Q9H0D6 CCDC144NL-AS1-215ENST00000582324 756 ntTSL 313.71□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 36
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XRN2Q9H0D6 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ZC3H7B-202ENST00000486331 5262 ntTSL 213.31□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 CSTF2-204ENST00000475126 1693 ntTSL 513.14□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 EIF4G1-211ENST00000422614 750 ntTSL 513.12□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 YWHAB-206ENST00000479421 1097 ntTSL 513.08□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ATAT1-207ENST00000462304 400 ntTSL 312.99□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 36
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XRN2Q9H0D6 ELAC2-208ENST00000484122 3738 ntTSL 212.9□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ATAT1-202ENST00000319027 2061 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 36
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XRN2Q9H0D6 ATAT1-201ENST00000318999 2611 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 RPL38-201ENST00000311111 1170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.453e-13■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ATAT1-203ENST00000329992 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 36
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XRN2Q9H0D6 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.477e-7■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 UNC13D-217ENST00000592386 930 ntTSL 512.1□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 RNF213-202ENST00000411702 6428 ntTSL 212.09□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.483e-7■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 YWHAB-202ENST00000372839 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ATAT1-205ENST00000376483 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 B4GALT1-201ENST00000379731 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 CCDC144NL-AS1-207ENST00000577537 3727 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 36
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XRN2Q9H0D6 CCDC144NL-AS1-218ENST00000583962 3352 ntTSL 1 (best)10.88□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 COPS8-201ENST00000354371 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 MECP2-201ENST00000303391 10505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 36
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XRN2Q9H0D6 GABPA-201ENST00000354828 5120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 PSD4-205ENST00000441564 11234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 36
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XRN2Q9H0D6 HELZ-210ENST00000581159 617 ntTSL 319.06■□□□□ 0.646e-9■■■■■ 36
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XRN2Q9H0D6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.466e-9■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ACTR3-203ENST00000443297 566 ntTSL 416.51■□□□□ 0.236e-9■■■■■ 36
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XRN2Q9H0D6 STRN4-209ENST00000594704 913 ntTSL 516.41■□□□□ 0.222e-11■■■■■ 36
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XRN2Q9H0D6 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.16e-9■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 STRN4-212ENST00000596012 560 ntTSL 414.22□□□□□ -0.132e-11■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 TBL1XR1-207ENST00000428970 575 ntTSL 413.77□□□□□ -0.214e-15■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ACTR3-202ENST00000415792 676 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.256e-9■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 HELZ-212ENST00000584641 1101 ntTSL 1 (best)13.29□□□□□ -0.286e-9■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.376e-9■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 UBAC1-205ENST00000486258 243 ntTSL 312.04□□□□□ -0.486e-9■■■■■ 36
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XRN2Q9H0D6 AZIN1-203ENST00000517581 576 ntTSL 411.3□□□□□ -0.66e-7■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 AZIN1-206ENST00000518940 574 ntTSL 311.04□□□□□ -0.646e-7■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 FYTTD1-203ENST00000415708 1342 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.936e-9■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 AZIN1-204ENST00000518353 773 ntTSL 58.61□□□□□ -1.036e-7■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 TBL1XR1-220ENST00000630796 656 ntTSL 58.44□□□□□ -1.064e-15■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 HELZ-202ENST00000417253 1872 ntTSL 57.89□□□□□ -1.156e-9■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 HELZ-208ENST00000580662 758 ntTSL 37.85□□□□□ -1.156e-9■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.416e-9■■■■■ 36
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