Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc5a4aQ9ET37 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Slc5a4aQ9ET37 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc5a4aQ9ET37 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms