Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930449I24RikQ9D5E3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930449I24RikQ9D5E3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930449I24RikQ9D5E3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930449I24RikQ9D5E3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930449I24RikQ9D5E3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930449I24RikQ9D5E3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930449I24RikQ9D5E3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930449I24RikQ9D5E3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930449I24RikQ9D5E3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
4930449I24RikQ9D5E3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930449I24RikQ9D5E3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms