Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phf6Q9D4J7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1004.5 ms