Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Susd3Q9D176 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Susd3Q9D176 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms