Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nip7Q9CXK8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nip7Q9CXK8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nip7Q9CXK8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nip7Q9CXK8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms