Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smim8Q9CQQ0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smim8Q9CQQ0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms