Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac9Q99N13 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac9Q99N13 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac9Q99N13 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac9Q99N13 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms