Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1bQ99JY6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1bQ99JY6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1bQ99JY6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms