Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcd2Q99JR8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcd2Q99JR8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcd2Q99JR8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcd2Q99JR8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcd2Q99JR8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcd2Q99JR8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcd2Q99JR8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smarcd2Q99JR8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcd2Q99JR8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcd2Q99JR8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarcd2Q99JR8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarcd2Q99JR8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarcd2Q99JR8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarcd2Q99JR8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcd2Q99JR8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcd2Q99JR8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcd2Q99JR8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smarcd2Q99JR8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms