Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sfxn1Q99JR1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfxn1Q99JR1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfxn1Q99JR1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms