Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clstn3Q99JH7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clstn3Q99JH7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms