Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nsl1Q8K305 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nsl1Q8K305 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.7 ms