Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam53cQ8BXQ8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam53cQ8BXQ8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam53cQ8BXQ8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms