Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm4aQ8BW72 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm4aQ8BW72 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm4aQ8BW72 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms