Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Pbrm1Q8BSQ9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Pbrm1Q8BSQ9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Pbrm1Q8BSQ9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Pbrm1Q8BSQ9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Pbrm1Q8BSQ9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Pbrm1Q8BSQ9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms