Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Npm2Q80W85 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Npm2Q80W85 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Npm2Q80W85 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Npm2Q80W85 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms