Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp397Q7TNK4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp397Q7TNK4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms