Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sarm1Q6PDS3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sarm1Q6PDS3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sarm1Q6PDS3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sarm1Q6PDS3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sarm1Q6PDS3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sarm1Q6PDS3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sarm1Q6PDS3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sarm1Q6PDS3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sarm1Q6PDS3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sarm1Q6PDS3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sarm1Q6PDS3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sarm1Q6PDS3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sarm1Q6PDS3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sarm1Q6PDS3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sarm1Q6PDS3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms