Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc66Q6NS45 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc66Q6NS45 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc66Q6NS45 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms