Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt39Q6IFX4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt39Q6IFX4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt39Q6IFX4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.8 ms