Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KdsrQ6GV12 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KdsrQ6GV12 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KdsrQ6GV12 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KdsrQ6GV12 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms