Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PatjQ63ZW7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PatjQ63ZW7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PatjQ63ZW7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms