Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps72Q62481 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps72Q62481 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms