Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tpd52Q62393 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpd52Q62393 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpd52Q62393 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpd52Q62393 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms