Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spock1Q62288 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spock1Q62288 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms