Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sall3Q62255 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sall3Q62255 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sall3Q62255 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms