Protein–RNA interactions for Protein: Q61553

Fscn1, Fascin, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn1Q61553 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fscn1Q61553 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fscn1Q61553 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fscn1Q61553 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fscn1Q61553 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fscn1Q61553 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Fscn1Q61553 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Fscn1Q61553 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fscn1Q61553 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fscn1Q61553 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fscn1Q61553 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fscn1Q61553 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fscn1Q61553 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fscn1Q61553 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fscn1Q61553 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fscn1Q61553 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fscn1Q61553 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms