Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Irf9Q61179 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irf9Q61179 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms