Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rbbp4Q60972 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms