Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKS4

Eri2, ERI1 exoribonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri2Q5BKS4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.3■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eri2Q5BKS4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eri2Q5BKS4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eri2Q5BKS4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eri2Q5BKS4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eri2Q5BKS4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eri2Q5BKS4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eri2Q5BKS4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eri2Q5BKS4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eri2Q5BKS4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eri2Q5BKS4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eri2Q5BKS4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eri2Q5BKS4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eri2Q5BKS4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eri2Q5BKS4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eri2Q5BKS4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.8 ms