Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL13

Gm527, Uncharacterized protein C14orf28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm527Q4KL13 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm527Q4KL13 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm527Q4KL13 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm527Q4KL13 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm527Q4KL13 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm527Q4KL13 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm527Q4KL13 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm527Q4KL13 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm527Q4KL13 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm527Q4KL13 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm527Q4KL13 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm527Q4KL13 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms