Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim9Q3V0X1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim9Q3V0X1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim9Q3V0X1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim9Q3V0X1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim9Q3V0X1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim9Q3V0X1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim9Q3V0X1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim9Q3V0X1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim9Q3V0X1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim9Q3V0X1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms